Bellona så tidlig EUs potensiale som foregangsregion for klima-, miljø- og energipolitikk, og har hatt et eget Brusselkontor siden 1994. Mye av kontorets innsats går på arbeidet med utviklingen av fangst og lagring av CO2 (CCS) og karbonnegative løsninger. Bellona Europa har gjennom mange år spilt en aktiv rolle i EUs teknologiplattform for CO2-fangst og – lagring (ZEP). I tillegg deltar kontoret i EUs teknologiplattform for biobrensler (EBTP). For øvrig arbeider Bellona Europa for å påvirke langsiktige EU prosesser til det beste for mennesker og miljø.
